差异表达分析(DEG)

其分析结果为找到两组间显著差异的基因
缺点是:可能会漏掉一些单独变化不大、但处于调控网络关键位置的基因

筛选逻辑

LogFC >0:基因在该组中上调
adj.P.Val(矫正后的P值)
过滤条件:LogFC>1 and adj.P.Val<0.05

FC:倍数变化,可调整

若认为FC>2,认为差异表达,则log2FC>1
若认为FC>1.5, 则 >0.58
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R语言实现

R包介绍

Attachments/Pasted image 20250927131401.png|450

绘图表现

箱式图
火山图
?差异基因热图